这种病毒是由H3N2亚型流感病毒和一种禽流感病毒在猪体内，与猪流感病毒混合后变异形成的。随后，这种由三种病毒混合形成的新病毒再度与北美H1N1猪流感病毒交叉，形成了北美甲型H1N1和北美甲型H1N2两种流感毒株。这两种毒株接着又与欧亚甲型H1N1病毒在猪体内混合，最终形成了现在的甲型H1N1流感病毒。科学家同时发现，甲型H1N1流感病毒的表面包裹着一层蛋白质，能增加该病毒在人与人之间传播的能力。
研究人员希望，通过解开甲型H1N1病毒的产生之谜，能够有效预防该病毒在人与人之间传播，并研制出有效的治疗方案。曾在东京国立传染病研究所供职的铭国昭博士表示：“了解了这种病毒的基因组成，我们就能研制出应对它的新方法。这种病毒未来可能还会发生变异，因此必须密切关注它的变化。”

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