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2000年，利君公司对科技体系进行了重大改革调整。设立了总工办、科技项目处和科技开发中心，着力加强科技项目管理，全面推行新产品开发项目承包制，极大地调动了科技人才的工作热情，促进了技术进步和科技创新能力的不断加强。在“九五”红霉素技术攻关顺利通过国家验收、利君沙被国家五部委认定为重点新产品，红霉素系列项目被列入陕西省重大科技产业化计划基础上，利君沙胶囊、利迈先胶囊、利喜定注射液等8个新产品相继获得新药证书和生产批准文号，其中利迈先胶囊、利喜定注射液、阿齐霉素冻干粉针(派奇)已推向市场，利喜定缓释片作为该公司的第一个缓释制剂在国内首家上市。
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